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發(fā)布時間:2021-07-28 04:48  
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在選用支原體PCR法檢測來替代藥典方法時,需要考慮如下兩個方面:
首先一步是要使用符合歐洲藥典要求,經過全方面驗證的支原體檢測試劑盒,第二部是自我驗證,即確認所用的樣本基質對于該試劑盒方法是合適的,并且操作過程是正確的。小規(guī)模的室內驗證通常需要采用三個不同批次的試劑盒,然后加入10CFU的標準品,做復孔(通常是8個復孔),并且至少選擇3個支原體物種進行驗證。
有的支原體標準品廠家會提供CFU與基因拷貝數的比值,以方便二者的換算。因為10CFU只能確定PCR能夠達到的檢測限在10CFU以下,但無法具體確定靈敏度的數值。帶DNA拷貝數標定的基因組DNA標準品則可進一步確定檢測限的數值。
總之,PCR方法很有用,但需要避免假陰性,驗證時應使用陽性對照、陰性對照、無模板對照和內控對照,以保證PCR反應正常,以及支原體少量存在時確實能檢出來,支原體不存在時也確保是結果陰性,從而使得PCR方法在工業(yè)應用時能確保zui終結果的可靠。
植物DNA的SDS提取法:1 取2-3g新鮮葉片,在液氮中研磨成粉狀(防止溶化)后轉入15ml離心管中。2 加入5ml于65℃預熱的提取緩沖液,65℃水浴保溫30min(搖動數次),使提取液與樣品充分混合。3 加入2ml5mol/LKAc,劇烈振蕩,冰浴保溫20min以上。4 2700×g離心20min,將上清液倒入新的15ml離心管中,(若提?。模危劣糜冢樱铮酰簦瑁澹颍畹葘嶒?一般在轉移上清時加濾膜,防止樣品殘渣混入,可保證DNA純度)。5 加入4ml氯1仿/異戊1醇(24∶1),搖勻,平衡,2700×g離心15min。6 在另一新的15ml離心管中加入5ml預冷的異丙1醇,將上清液用移液槍轉入此管,在-20℃冷卻30min以上。7 2700×g離心10min,棄去上清液,用4ml70%乙醇洗滌,室溫保持10min。2700×g離心3min,倒去上清液。8 重復步驟7,用4ml70%乙醇洗滌,室溫保持10min。2700×g離心3min,倒去上清液。超凈工作臺內吹干(3h左右)。9 加1mlTE緩沖液中溶解,加10μlRNase(10mg/ml),在37℃恒溫箱中溫育20min。10 再加100μl3mol/LNaAc和2ml無水乙醇,2700×g離心3min,倒去上清液。超凈工作臺內吹干(3h左右)。11 將DNA沉淀溶于150μlTE中,置于超凈工作臺內(3h左右)。將TE溶液轉入已滅菌的1 5mleppendorf管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?

棉花等酚類、多糖類物質較多的植物DNA提取法:
1 取2g新鮮幼嫩的葉片放入研缽中,加入液氮后快速、充分研磨,待成極細的粉末狀時迅速轉入到50ml離心管中。
2 在50ml離心管中加入10ml冰預冷的提取緩沖液,在渦懸振蕩器上充分混勻。
3 于4℃,2700×g離心20分鐘,倒去上清液。
4 在沉淀中加入5ml裂解緩沖液,在渦旋振蕩器上充分混勻。
5 于65℃水浴鍋中溫育30min。
6 加入5ml氯1仿/異戊1醇(24/1),并上下翻轉以充分混合。
7 于4℃,2700×g離心5分鐘。
8 轉移上層水相至一新的50ml離心管中。
9 重復步驟7-9一次。
10 加入2/3體積的冰預冷的異丙1醇,并上下翻轉以充分混合,至-20℃2h。
11 于4℃,1200×g離心10min。
12 在一新管中加入20ml含80%乙醇15mmol/LNaAc溶液,用玻棒將DNA轉入該管(如不能直接用玻棒纏出,可離心后倒出上清,再在其中加入20ml含80%乙醇15mmol/LNaAc溶液),放置20min后稍許離心,移走上清并吸出殘存乙醇,室溫干燥。
13 加入1 0mlTE(10mmol/LTris-HClPH=8 0,1mmol/LEDTA)并加入終濃度為20(g/L的RNaseA,過夜。
14 風干,用50μlTE緩沖液溶解,存于-20℃?zhèn)溆谩?br />
鼻咽拭子的采集
被采集人員需要 保持頭部不動,采樣人員去除鼻腔內壁的分泌物。然后采樣人員一手輕扶被采集人員頭部,一手將鼻咽拭子緩緩插入鼻腔至鼻咽部。在鼻咽部,拭子將停留數秒吸取分泌物,而后采樣人員輕輕旋轉取出拭子,將樣本保存并送檢。
咽拭子的采集
被采集人員先用 生理鹽水漱口,采樣人員將拭子放入無菌生理鹽水中濕潤。被采集人員頭部微仰并保持不動,嘴張大,并發(fā)“啊”音,露出兩側咽扁桃體,采集人員將拭子越過舌根,在被采集者兩側咽扁桃體稍微用力來回擦拭至少3次,然后再在咽后壁上下擦拭至少3次。
需要注意的是,兩種采集方法, 被采集人員均會稍感不適,所以在采樣的過程中,被采集人員需稍稍克服一下不適感, 配合采樣人員的工作。不可過度活動頭部,以免拭子劃傷粘膜。如被采集人員發(fā)生刺激性咳嗽,采集過程需稍作暫停。