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pcr實驗室分子生物學(xué)檢測「在線咨詢」

發(fā)布時間:2021-05-10 04:30  

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ELISA 是一種結(jié)合抗原、抗ti特異性反應(yīng)和酶對底物高xiao催化作用的高敏感性免yi學(xué)實驗技術(shù)。ELISA 的基礎(chǔ)是抗原或抗ti的固相化及抗原或抗ti的酶標(biāo)記。結(jié)合在固相載體表面的抗原或抗ti仍保持其免yi學(xué)活性,酶標(biāo)記的抗原或抗ti既保留其免yi學(xué)活性,又保留酶的活性。在測定時,受檢標(biāo)本(測定其中的抗ti或抗原)與固相載體表面的抗原或抗ti起反應(yīng),洗滌使固相載體上形成的抗原抗ti復(fù)合物與液體中的其他物質(zhì)分開,再加入酶標(biāo)記的抗原或抗ti,通過反應(yīng)使其結(jié)合在固相載體上。此時固相上的酶含量與標(biāo)本中受檢物質(zhì)的量呈一定的比例。EMSA實驗EMSA:凝膠遷移或電泳遷移率檢測是一種檢測蛋白質(zhì)和DNA序列相結(jié)合的技術(shù),初用于研究DNA結(jié)合蛋白和其相關(guān)的DNA結(jié)合序列相互作用,可用于定性和定量分析。加入酶反應(yīng)的底物,底物被酶催化成為有色產(chǎn)物,產(chǎn)物的量與標(biāo)本中受檢物質(zhì)的量直接相關(guān),故可根據(jù)呈色的深淺進行定性或定量分析。




miRNA測序

microRNA(miRNA)是一種大小約21—23個堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的約70-90個堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(雙鏈)但是和siRNA密切相關(guān)。microRNA通過和靶基因mRNA堿基配對引導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻譯,從而在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控蛋白表達(dá)(新發(fā)現(xiàn)miRNA也能在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達(dá))。miRNA在物種進化中相當(dāng)保守,在動物、植物和真菌等中發(fā)現(xiàn)的miRNA表達(dá)均有嚴(yán)格的組織特異性和時序性。miRNA在細(xì)胞生長和發(fā)育過程中起多種作用,包括調(diào)控發(fā)育、分化、凋亡和增殖等。用1ml70%乙醇洗滌沉淀物1次,離心12000rpm,5min。

目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技術(shù)以及第二代測序技術(shù)。基于第二代測序技術(shù)的miRNA測序,可以一次獲得數(shù)百萬條miRNA序列,能夠快速鑒定出不同組織、不同發(fā)育階段、不同疾病狀態(tài)下已知和未知的miRNA及其表達(dá)差異,為研究miRNA對細(xì)胞進程的作用及其生物學(xué)影響提供了有力工具。結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4°C待電泳檢測或-20°C長期保存。





二、大腸菌群檢驗方法:

由于大腸菌群指的是具有某些特性的一組與糞便污染有關(guān)的細(xì)菌,即:需氧及兼性厭氧、在37°C能分解乳糖產(chǎn)酸產(chǎn)氣的革蘭氏陰性無芽胞。因此大腸菌群的檢測一般都是按照它的定義進行。 目前國內(nèi)采用的進出口食品大腸菌群檢測方法主要有國家標(biāo)準(zhǔn)和原國家商檢局制訂的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)。兩個標(biāo)準(zhǔn)方法在檢測程序上略有不同。標(biāo)準(zhǔn)的生物信息學(xué)分析能夠得到mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA各自的研究內(nèi)容,靶向調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、ceRNA網(wǎng)絡(luò)、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析可以將這幾種RNA聯(lián)合起來分析,從而發(fā)現(xiàn)新的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型。

(一)國家標(biāo)準(zhǔn):國家標(biāo)準(zhǔn)采用三步法,即:乳糖發(fā)酵試驗、分離培養(yǎng)和證實試驗。乳糖發(fā)酵試驗:樣品稀釋后,選擇三個稀釋度,每個稀釋度接種三管乳糖膽鹽發(fā)酵管。36士1C培養(yǎng)48土2h,觀察是否產(chǎn)氣。分離培養(yǎng):將產(chǎn)氣發(fā)酵管培養(yǎng)物轉(zhuǎn)種于伊紅美藍(lán)瓊脂平板上,36士1°C培養(yǎng)18-24h,觀察菌落形態(tài)。證實試驗:挑取平板上的菌落,進行革蘭氏染色觀察。腺病毒包裝原理介紹腺病毒是一種沒有包膜的直徑為79-90nm的顆粒,由252個殼粒呈二十面體排列構(gòu)成。同時接種乳糖發(fā)酵管36士1°C培養(yǎng)24土2h,觀察產(chǎn)氣情況。

報告:

根據(jù)證實為大腸陽性的管數(shù),查MPN表,報告每100ml ( g)大腸菌群的MPN值。具體操作參見GB4789. 3-94 《中華人民共和國國家標(biāo)準(zhǔn)食品衛(wèi)生微生物學(xué)檢驗大腸菌群測定》

(二)原國家商檢局制訂的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),等效采用美國FDA的標(biāo)準(zhǔn)方法,用于對出口食品中的大腸進行檢測。本方法采用兩步法:推測試驗:樣品稀釋后,選擇三個稀釋度,每個稀釋度接種三管LST肉湯。36士1C培養(yǎng)48士2h,觀察是否產(chǎn)氣。證實試驗:將產(chǎn)氣管培養(yǎng)物接種煌綠乳糖膽鹽(BGLB)肉湯管中,36士1°C培養(yǎng)48士2h,觀察是否產(chǎn)氣。以BGLB產(chǎn)氣為陽性。分子實驗介紹——熒光檢測細(xì)胞熒光染色是以熒光物質(zhì)標(biāo)記而進行抗原定位的技術(shù)。查MPN表,報告每ml(g)樣品中大腸菌群的MPN值。具體操作參見SN0169-92《中華人民共和國進出口商品檢驗行業(yè)標(biāo)準(zhǔn) 出口食品中大腸菌群、糞大腸菌群和大腸檢驗方法》




EMSA實驗

EMSA:凝膠遷移或電泳遷移率檢測是一種檢測蛋白質(zhì)和DNA序列相結(jié)合的技術(shù),初用于研究DNA結(jié)合蛋白和其相關(guān)的DNA結(jié)合序列相互作用,可用于定性和定量分析。分為2種類型:同位素標(biāo)記探針,非同位素標(biāo)記探針。

通常將純化的蛋白和細(xì)胞粗提液和32P同位素標(biāo)記的DNA或RNA探針一同保溫,在非變性的聚bing烯凝膠電泳上,分離復(fù)合物和非結(jié)合的探針。DNA-復(fù)合物或RNA-復(fù)合物比非結(jié)合的探針移動得慢。同位素標(biāo)記的探針依研究的結(jié)合蛋白的不同,可是雙鏈或者是單鏈。當(dāng)檢測如轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子一類的DNA結(jié)合蛋白,可用純化蛋白,部分純化蛋白,或核細(xì)胞抽提液。在檢測RNA結(jié)合蛋白時,依據(jù)目的RNA結(jié)合蛋白的位置,可用純化或部分純化的蛋白,也可用核或胞質(zhì)細(xì)胞抽提液。競爭實驗中采用含蛋白結(jié)合序列的DNA或RN片duan和gua核苷酸片段(特異),和其它非相關(guān)的片段(非特異),來確定DNA或RNA結(jié)合蛋白的特異性。隨后設(shè)計BSP引物進行PCR,在擴增過程中尿嘧定全部轉(zhuǎn)化為胸腺嘧定,zui后對PCR產(chǎn)物進行測序就可以判斷CpG位點是否發(fā)生jia基化,稱為BSP-直接測序法。在競爭的特異和非特異片段的存在下,依據(jù)復(fù)合物的特點和強度來確定特異結(jié)合。