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發(fā)布時間:2021-03-31 08:36  
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亞細(xì)胞定位是一種生物信息學(xué)上的概念,一般不是學(xué)生物的很少接觸到這一類的東西,甚至連聽都沒有聽說過,就算是學(xué)習(xí)生物化學(xué)的,也不一定會接觸亞細(xì)胞定位這方面。亞細(xì)胞定位要研究蛋白質(zhì)的細(xì)胞定位,是在外面完成的一種實驗,不能再體內(nèi)蛋白質(zhì)細(xì)胞中完成,所以,研究的成本比較高,對專業(yè)知識的要求比較高。使用基于的熒光顯微分析技術(shù),替代傳統(tǒng)的質(zhì)譜繪圖技術(shù),研究人員使用13993種,定位了細(xì)胞間隔和亞結(jié)構(gòu)內(nèi)的12003種蛋白質(zhì),共計完成了13個主要細(xì)胞器的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。如果不是學(xué)這個的,了解了也沒有什么用,專業(yè)研究的才會潛心研究。
武漢邁斯普生物科技有限公司是一家專業(yè)從事生物醫(yī)學(xué)技術(shù)服務(wù)、技術(shù)咨詢及產(chǎn)品開發(fā)的生物技術(shù)服務(wù)企業(yè)。公司坐落于武漢光谷,由3位歸國博士創(chuàng)辦。公司長期致力于建立并完善多項基礎(chǔ)生物技術(shù)服務(wù)平臺。GaMYB2在洋蔥表皮細(xì)胞中的瞬時表達(dá)分析:采用基因槍轟擊的方法,用包裹質(zhì)粒的金粉對洋蔥表皮進(jìn)行轟擊,暗培養(yǎng)過夜后,在激光共聚焦顯微鏡下進(jìn)行觀察,從圖A中可以看出對照GFP空載體在整個洋蔥細(xì)胞均能看到綠色熒光,為組成型表達(dá)。現(xiàn)憑借自身技術(shù)特色,依托光谷生物城技術(shù)產(chǎn)業(yè)優(yōu)勢,面向全國提供生物技術(shù)服務(wù)。
GFP,實際是給你要研究的物質(zhì)加上標(biāo)記,在此相當(dāng)于報告蛋白1653的作用。使用GFP必須構(gòu)建融合蛋白載體,并在轉(zhuǎn)染之后有效表達(dá)。上述結(jié)果收錄在TheCellAtlas中,成為人類蛋白組計劃(HumanProteinAtlas)框架內(nèi)的重要組成部分。這樣,若在熒光顯微鏡下看到細(xì)胞內(nèi)某一部位存回在GFP信號,說明和GFP融合的蛋白也存在于該部位,這樣就達(dá)到了確定某答物質(zhì)亞細(xì)胞定位的目的。
亞細(xì)胞定位是指某種蛋白或某個基因表達(dá)產(chǎn)物在細(xì)胞內(nèi)的具體存在部位,包括細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜等部位。傳統(tǒng)的實驗方法有,利用一些熒光蛋白如GFP、YFP,通過其在激光照射下發(fā)出的綠色或黃色熒光,從而準(zhǔn)確確定編碼蛋白的定位。如果面對質(zhì)譜打出來很多蛋白,傳統(tǒng)的實驗方法顯得十分乏力。2.關(guān)鍵酶糖酵解途徑中大多數(shù)反應(yīng)是可逆的,但有3個反應(yīng)基本上不可逆,分別由己糖激酶(或葡萄糖激酶),6-磷酸果糖激酶-1和酸激酶催化,是糖酵解途徑流量的3個調(diào)節(jié)點,所以被稱為關(guān)鍵酶。如果能利用生物信息學(xué)手段基于一些算法如機器學(xué)習(xí)等開發(fā)的方法進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測分析輔助于實驗,這樣就能省時省力節(jié)約成本。
通過對目的蛋白的標(biāo)記,例如融合綠色熒光蛋白GFP,使用掃描共聚焦顯微鏡激發(fā)熒光,從而對蛋白的表達(dá)分布予以確認(rèn)。依據(jù)對亞細(xì)胞分布的準(zhǔn)確度不同,亞細(xì)胞定位的實驗設(shè)計也分成簡化型亞細(xì)胞定位分析和內(nèi)參型共定位分析。從圖B中發(fā)現(xiàn)GaMYB2-GFP的融合表達(dá)載體只能在細(xì)胞核中能看到綠色熒光,這進(jìn)一步證明該蛋白不具有跨膜蛋白結(jié)構(gòu),定位在細(xì)胞核中,具有轉(zhuǎn)錄因子的一般特征。對于植物蛋白的亞細(xì)胞定位分析,主要通過構(gòu)建融合熒光蛋白的過表達(dá)質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化煙1草和原生質(zhì)體瞬時表達(dá)體系確定其定位及共定位情況。