在農(nóng)業(yè)的部獲得登記的生物有機(jī)肥生產(chǎn)企業(yè)，基本上以從事微生物肥料生產(chǎn)為主，在發(fā)酵生產(chǎn)工藝上，多采用槽式堆置發(fā)酵法，還有其他的發(fā)酵方法，如：平地堆置發(fā)酵法、發(fā)酵槽發(fā)酵法、密封倉(cāng)式發(fā)酵法等在生產(chǎn)中也得到了應(yīng)用。在發(fā)酵腐熟過(guò)程中物料的水分、碳氮比、溫度等的調(diào)節(jié)及腐熟劑的使用是生產(chǎn)工藝的關(guān)鍵，特別是菌劑的應(yīng)用直接影響著物料發(fā)酵的周期及腐熟程度。經(jīng)過(guò)腐熟的物料基本實(shí)現(xiàn)了產(chǎn)品的無(wú)害化，從而也有利于后處理過(guò)程中所加入功能菌的存活。

微生物菌是生物有機(jī)肥料產(chǎn)品的核心，在生產(chǎn)過(guò)程中，一般有兩個(gè)環(huán)節(jié)涉及到微生物的使用：

一是在腐熟過(guò)程中加入促進(jìn)物料分解、腐熟兼具除臭功能的腐熟菌劑，其多由復(fù)合菌系組成，常見(jiàn)菌有光合菌、乳酸菌、酵母菌、放線、青霉、木霉等；

二是在物料腐熟后加入的功能菌，一般以同氮菌、溶磷菌、硅酸鹽細(xì)菌、乳酸菌、假單胞菌、放線等為主，在產(chǎn)品中發(fā)揮特定的肥料效應(yīng)。因此，對(duì)生物有機(jī)肥生產(chǎn)來(lái)說(shuō)，微生物菌的篩選、使用是一項(xiàng)核心技術(shù)，只有掌握了這一項(xiàng)關(guān)鍵技術(shù)，才能加快物料的分解、腐熟，以及保證產(chǎn)品的應(yīng)用效果。

生物有機(jī)肥質(zhì)量的優(yōu)劣主要取決于其中所含益生菌的作用強(qiáng)度和活菌數(shù)量， 目前生物有機(jī)肥的生產(chǎn)中通常使用活性強(qiáng)且耐高溫、高滲、干旱等抗逆性較強(qiáng)的菌，且在生產(chǎn)過(guò)程中要考慮各種菌劑之間的相互作用，不可隨意混合。根據(jù)微生物在生產(chǎn)中的作用可分為發(fā)酵菌和功能菌。發(fā)酵菌多由復(fù)合菌系組成，具有促進(jìn)物料分解、腐熟、除臭的功能，常用菌有酵母菌、光合細(xì)菌、乳酸菌、青霉、木霉、根霉等；功能菌是指能在產(chǎn)品中發(fā)揮特定的肥料效應(yīng)的微生物，以固氮菌、溶磷菌、硅酸鹽細(xì)菌等為主，在物料腐熟后加入。

生物有機(jī)肥是指特定功用微生物與主要以動(dòng)植物殘?bào)w為來(lái)源并經(jīng)無(wú)害化處置、腐熟的有機(jī)物料復(fù)合而成的一類兼具微生物肥料和有機(jī)肥效應(yīng)的肥料。那么施用生物有機(jī)肥需求留意哪些問(wèn)題呢？選用質(zhì)量合格的微生物肥料。質(zhì)量低下、有效活菌數(shù)達(dá)不到規(guī)則指標(biāo)、雜菌含量高或已過(guò)有效期的產(chǎn)品不能施用。施用時(shí)盡量減少肥料中微生物的死去。應(yīng)防止陽(yáng)光直射菌肥，拌種時(shí)應(yīng)在陰涼處操作，拌種后要及時(shí)播種，并立刻覆土。普通菌肥不可與有害的藥、化肥混合施用。