擴增檢測實驗室原則上分為4個單獨的工作區(qū)域：試劑儲存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增反應混合物配制和擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染，進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行。

 雖然這些污染對PCR實驗結(jié)果的影響已經(jīng)受到了廣泛重視，多數(shù)實驗室對污染控制都采取了各種辦法，比如定期大掃除清理、劃分操作區(qū)域、試劑分裝、操作謹慎、重復實驗、多角度驗證結(jié)果。但是微量的核酸片段就能被擴增，所以對污染物的控制不僅僅是做到這些就能夠杜絕和避免的，關(guān)鍵是需要從源頭控制。

 對結(jié)果有效性不利影響的因素可能包括但不限于：微生物污染、灰塵、電磁干擾、輻射、濕度、供電、溫度、聲音和震動。舉個例子：一般使用的玻璃量器如移液管、容量瓶使用溫度都是在20℃，溫度過低或過高都會影響配制試劑濃度的度。實驗室的溫度必須控制在（20±5）℃范圍內(nèi)才能確保檢測數(shù)據(jù)的誤差在可控范圍內(nèi)。除此之外實驗室還應保持良好的內(nèi)務管理，減少環(huán)境對檢測結(jié)果的影響。

 然而，并非所有學者都用得上這樣的網(wǎng)站。Garry Cooper在美國西北大學范伯格醫(yī)學院做博士后研究神經(jīng)生理學時，就沒有這樣的網(wǎng)站。2015年的一天，他正在幫忙清理實驗室里的一臺冰箱，然后突然意識到需要這樣一個平臺：雖然他一直在把一些昂貴的試劑送給一個博士生，但是仍有大量被扔掉，那是一種常用但價格昂貴的研究工具，用于鑒定蛋白質(zhì)。

數(shù)據(jù)分析軟件：這是NGS實驗室特有的環(huán)節(jié)，實驗室需要用商品試劑配套的軟件進行數(shù)據(jù)分析，并確認使用軟件的版本和數(shù)據(jù)庫的現(xiàn)行有效版本；數(shù)據(jù)需要專業(yè)的生信人員進行分析，需要在數(shù)據(jù)預處理、數(shù)據(jù)比對、數(shù)據(jù)質(zhì)控、分析判斷等每個流程進行質(zhì)控，確保數(shù)據(jù)分析的準確性。檢查人員強調(diào)，實驗室安全關(guān)系到全監(jiān)測站每一位職工的安全，特別是有毒有害試劑的存放管理要嚴格、規(guī)范，有毒有害試劑的泄漏、流出和使用不當均會帶來不可估計的損失，要做到“全覆蓋、零容忍”，堅決杜絕有毒有害試劑事故的發(fā)生，確保職工的人身財產(chǎn)安全，維護單位工作環(huán)境和諧穩(wěn)定。