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子公司和分公司的稅收利益存在著較大差異，公司企業(yè)在選擇組織形式時(shí)應(yīng)細(xì)心比較、統(tǒng)籌考慮、正確籌劃。但總體上看兩種組織形式重要的區(qū)別在于：

子公司是獨(dú)立的法人實(shí)體，在設(shè)立國被視為居民納稅人，通常要承擔(dān)與該國其它公司一樣的納稅義務(wù)。分公司不是獨(dú)立的法人實(shí)體，在設(shè)立分公司的所在國被視為非居民納稅人，只承擔(dān)有限的納稅義務(wù)。分公司發(fā)生的利潤與虧損要與總公司合并計(jì)算，即“合并報(bào)表”。我國稅法也規(guī)定，公司的下屬分支機(jī)構(gòu)繳納所得都有兩種形式：一是獨(dú)立申報(bào)納稅；一是合并到總公司匯總納稅。而采用哪種形式繳稅則取決于公司下屬分支機(jī)構(gòu)的性質(zhì)--是否為企業(yè)所得稅獨(dú)立的納稅義務(wù)人。

這里必須指出，境外分公司與總公司利潤合并計(jì)算，所影響的是居住國的稅收負(fù)擔(dān)，至于作為分公司所在的東道國，往往照樣要對(duì)歸屬于分公司本身的收入課稅，這就是實(shí)行所謂收入來源稅收管轄權(quán)。而設(shè)立在境內(nèi)分公司則不存在這個(gè)問題，對(duì)這一點(diǎn)企業(yè)在稅籌劃時(shí)應(yīng)加以關(guān)注