企業(yè)應(yīng)正確歸集研發(fā)費(fèi)用，由具有資質(zhì)并符合本《工作指引》相關(guān)條件的中介機(jī)構(gòu)進(jìn)行專項(xiàng)審計或鑒證。高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定所指的知識產(chǎn)權(quán)須在中國境內(nèi)授權(quán)或?qū)徟鷮彾ǎ⒃谥袊傻挠行ПＷo(hù)期內(nèi)。知識產(chǎn)權(quán)權(quán)屬人應(yīng)為申請企業(yè)。在申請認(rèn)定時的有效性以企業(yè)申請認(rèn)定前獲得授權(quán)證書或授權(quán)通知書并能提供繳費(fèi)收據(jù)為準(zhǔn)；如果拿到了授權(quán)通知書并且交了登記費(fèi)和相應(yīng)的年費(fèi)，但還沒拿到證書的，也可以用于申請高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定。

《高新認(rèn)定管理辦法》要求企業(yè)每年高新產(chǎn)品（服務(wù)）取得的收入要占到當(dāng)年總銷售收入的60%以上。建議企業(yè)應(yīng)持續(xù)開展研究開發(fā)活動，有計劃的組織調(diào)查、研究開發(fā)，提高企業(yè)的創(chuàng)新能力，加強(qiáng)技術(shù)改進(jìn)。對于企業(yè)委托外部研究開發(fā)部分費(fèi)用，需要符合獨(dú)立交易原則，且其計入研發(fā)費(fèi)用總額未超過規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)；企業(yè)支付的特許權(quán)使用費(fèi)應(yīng)沒有作為委托外部研究開發(fā)費(fèi)用計入研發(fā)費(fèi)用總額。

高企認(rèn)定以三年為期，考察企業(yè)的知識產(chǎn)權(quán)、科技成果轉(zhuǎn)化能力、研發(fā)組織管理制度水平及成長性，從各方面來評審企業(yè)的現(xiàn)有技術(shù)水平及未來發(fā)展?jié)撃?，并篩選出滿足高企認(rèn)定要求的企業(yè)給予政策上的優(yōu)惠和獎勵。企業(yè)通過高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定后，需要到地方稅務(wù)機(jī)關(guān)備案，申請享受企業(yè)所得稅減按15%執(zhí)行的繳稅優(yōu)惠，以免錯失稅收優(yōu)惠資格。高企認(rèn)定工作指引指出企業(yè)創(chuàng)新能力評價體系中研究開發(fā)組織管理水平評分占比20%，這就要求企業(yè)在日常研發(fā)過程中對研發(fā)流程的梳理、管理制度的執(zhí)行、獎勵政策的體現(xiàn)都要明確規(guī)范。

高新技術(shù)企業(yè)，是指在《國家重點(diǎn)支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》內(nèi)，持續(xù)進(jìn)行研究開發(fā)與技術(shù)成果轉(zhuǎn)化，形成企業(yè)核心自主知識產(chǎn)權(quán)，并以此為基礎(chǔ)開展經(jīng)營活動，在中國境內(nèi)（不包括港、澳、臺地區(qū)）注冊的居民企業(yè)。高企對企業(yè)的要求大約如下：不低于10%的研發(fā)人員，近三年研發(fā)費(fèi)用不低于4% (營業(yè)額達(dá)到兩億以上的企業(yè))或5% (營業(yè)額兩億以下的企業(yè))，近三年的年度審計報告，企業(yè)創(chuàng)新能力評價分在70分以上。在申請高新技術(shù)企業(yè)及高新技術(shù)企業(yè)資格存續(xù)期內(nèi)，知識產(chǎn)權(quán)有多個權(quán)屬人時，只能由一個權(quán)屬人在申請時使用。