在蘋果、柑橘、葡萄、梨、草莓、李子和獼猴桃等多個樹種上的研究結果表明，生物有機肥明顯提高了果品品質。內在品質上主要提高了果實的可溶性固形物和含糖量、糖酸比和香氣品質；從外在品質看，提高了果實著色度和硬度，果形大小較勻稱。在設施栽培桃上的研究結果表明，施用生物有機肥比對照施用雞糞明顯改善了桃子品質，可溶性糖含量增加1.0%，可滴定酸含量降低3.5%；施用生物有機肥的紅地球葡萄果實糖度達到14.39；顯著改善了富士蘋果果實的香氣品質，揮發(fā)性物質多13個成分，含量多5.7個百分點。

在農業(yè)的部獲得登記的生物有機肥生產企業(yè)，基本上以從事微生物肥料生產為主，在發(fā)酵生產工藝上，多采用槽式堆置發(fā)酵法，還有其他的發(fā)酵方法，如：平地堆置發(fā)酵法、發(fā)酵槽發(fā)酵法、密封倉式發(fā)酵法等在生產中也得到了應用。在發(fā)酵腐熟過程中物料的水分、碳氮比、溫度等的調節(jié)及腐熟劑的使用是生產工藝的關鍵，特別是菌劑的應用直接影響著物料發(fā)酵的周期及腐熟程度。經過腐熟的物料基本實現(xiàn)了產品的無害化，從而也有利于后處理過程中所加入功能菌的存活。

看物料。是否均勻。抓一把肥料在陽光下觀察，陰潮呈團、干燥呈灰都非正常產品。適合特殊功能菌中生長的“有機肥營養(yǎng)”應是套餐型，由多種有機營養(yǎng)物質組成(如：菜粕、黃豆粉等發(fā)酵制成)，在光線下能看到原料的痕跡，或者能聞到原料的特殊氣味。看效果。加少量水將生物有機肥調成團狀，放在冰箱里凍成冰塊，然后拿出來溶化，反復三次，肥料中的菌中將會凍死或大幅度減少；這是用它和將原產品進行比較試驗、在相同的田塊里觀察差異，差異明顯好肥料，差異不明顯，表明該產品有問題，建議放棄使用。