生物肥料（微生物肥料）的種類較多，按照制品中特定的微生物種類可分為菌肥料（如根瘤菌肥、固氮菌肥）、線菌肥料（如抗生菌肥料）、菌類肥料（如菌根菌）；按其作用機理分為根瘤菌肥料、固氮菌肥料（自生或聯(lián)合共生類）、解磷菌類肥料、硅酸鹽菌類肥料；按其制品內(nèi)含分為單一的微生物肥料和復合（或復混）微生物肥料。兩者各有優(yōu)缺點，有機肥應與化肥配合施用才能揚長避短，充分發(fā)揮其效益。復合微生物肥料又有菌、菌復合，也有菌和各種添加劑復合的。

中國地域遼闊，人口眾多，有機肥料資源十分豐富。有機質(zhì)的結(jié)構(gòu)物質(zhì)主要是碳（C），所以這種比例稱為碳氮化（C/N），C/N大于30的有機肥料其作用以改土為主，C/N小于30的有機肥料其作用以供應養(yǎng)分為主。種類多，數(shù)量大，是中國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的重要肥源，但它也是農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)生產(chǎn)的副產(chǎn)物。可以說，哪里有農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)、哪里就有有機肥源。城市中可以利用的有機生活垃圾，主要來自農(nóng)產(chǎn)品和畜產(chǎn)品。所以農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)越發(fā)展，有機肥資源就越豐富。根據(jù)全國各地區(qū)調(diào)查，使用的有機肥料就有14類100多種。人糞尿是一項重要有機肥源。平均每個成年人每年糞尿排泄量約為790公斤，折含氮素(N)4.4公斤，磷素(P2O5)1.36公斤，鉀素(K2O)1.67公斤。如以人糞收集利用率按60%、人尿30%計算，中國農(nóng)村人口有9億，折合為成年人，每年就可積攢人糞尿1600多億公斤，可為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供氮素90萬噸，磷素28萬噸，鉀素34萬噸。

據(jù)中國農(nóng)業(yè)年鑒1990年資料，中國存欄數(shù)約3.4億頭，牛近1億頭，馬騾驢2700萬匹，這些家畜排泄物數(shù)量大，養(yǎng)分豐富，是中國農(nóng)村大的有機肥資源。瓜果蔬菜、柑橘、臍橙、草莓、龍眼、菠蘿、柚樹、香蕉、枇杷、獼猴桃、荔枝、蘋果、梨、葡萄等。其中豬每年可為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供氮素130多萬噸，磷素85萬噸，鉀素180萬噸；大牲畜可提供氮160多萬噸，磷83萬噸，鉀110多萬噸。加上每年有30多億只家禽和10多億只兔，其提供的養(yǎng)分量占農(nóng)村有機肥料總量的63%～72%。